Die ärztlichen Organe der PVS Südwest setzen die Vorgaben für das operative Geschäft der Privatabrechnung mit der PVS Südwest.
Nach dem Genossenschaftsprinzip sind die Kunden der PVS Südwest gleichzeitig ihre alleinigen Eigentümer. Als organisatorische Klammer fungieren dabei drei gemeinnützige Vereine: Der PVS Kurpfalz e.V., der PVS Karlsruhe e.V. und der PVS Südbaden e.V.
Der PVS Kurpfalz e.V., der PVS Karlsruhe e.V. sowie die von dem PVS Südbaden e.V. geleitete PVS GmbH Freiburg führen die PVS Südwest als gemeinsame Tochtergesellschaft. Durch die Mitgliedschaft in einem der drei Vereine stimmt jeder Kunde dem Selbstverständnis der Gemeinschaftseinrichtung zu und erhält Zugang zum Dienstleistungsangebot der PVS Südwest.
Die Mitgliederversammlungen der Vereine sind die höchsten Entscheidungsinstanzen der PVS Südwest. Sie tagen in regelmäßigen Abständen, nehmen die Jahres- und Bilanzberichte entgegen und entlasten den Vorstand und die Geschäftsführung.
Die ärztlichen Vorstände verantworten die laufenden Aktivitäten der Vereine. Insbesondere obliegt ihnen dabei im Sinne eines Aufsichtsrats die Überwachung der laufenden Geschäfte durch die Geschäftsführung.
In der PVS Privatärztliche Verrechnungsstelle Südwest GmbH sind die operativen Geschäfte rund um die Privatabrechnung zusammengefasst. Als 100-prozentige Tochter der ärztlichen Vereine verantwortet die Gesellschaft ihre wirtschaftlichen Strategien und Erfolge ausschließlich gegenüber den ärztlichen Mitgliedern.